先有雞還是先有蛋——這個帶著哲學(xué)思考的科學(xué)問題輾轉(zhuǎn)至今也未被完全解答。拋開這個千古難題，在漫長的歲月里，雞不僅征服了全球，也征服了人類餐桌。雞肉幾乎無人不食，雞蛋做法簡單粗暴而美味、雞肉更是煎炒烹所向披靡。

康相濤國家獎?wù)掌?/p>

康相濤教授在科研基地

康相濤教授在雞場指導(dǎo)育種工作

家雞是世界上最早馴化的動物之一。多項證據(jù)表明家雞是由紅原雞的一個亞種馴化而來，但其它原雞屬（灰原雞、綠原雞和黑尾原雞）也對家雞存在基因滲入現(xiàn)象。因此，家雞不僅是從紅原雞進(jìn)化而來，而且是多個原雞混合形成的品種。而現(xiàn)在家雞的參考基因組僅從一只紅原雞測序組裝而來，當(dāng)前的參考基因組(GRCg6a)不能夠覆蓋所有家雞的遺傳變異。同時，近年來研究發(fā)現(xiàn)大量的表型變異是由基因組結(jié)構(gòu)變異導(dǎo)致的，因此，構(gòu)建雞的泛基因組，不僅可以完善雞基因組，而且可捕獲更多的結(jié)構(gòu)變異，用來解析表型變異的遺傳基礎(chǔ)。

近日，河南農(nóng)業(yè)大學(xué)康相濤教授團(tuán)隊與澳大利亞西澳大學(xué)等單位合作，構(gòu)建了首個雞泛基因組，并解析了影響雞生長性狀主效基因IGF2BP1的致因突變。7月30日，該研究成果在國際著名期刊MolecularBiologyandEvolution（IF=16.24），以Article形式在線發(fā)表。

該研究共使用了868只雞的二代測序數(shù)據(jù)。其中，359只雞的數(shù)據(jù)來自河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場于2003年建立的固始-安卡雞F2代資源群以及保存的固始雞、淅川烏骨雞保種群，509只雞的數(shù)據(jù)來源于公共數(shù)據(jù)庫。基于“Reference-basedIterativeMappingandAssembly”方法，利用664只雞的數(shù)據(jù)構(gòu)建了首個雞的泛基因組，發(fā)現(xiàn)有~66.5Mb的序列在目前參考基因組中不存在。全基因組PAV（Presence/Absencevariation）分析發(fā)現(xiàn)：選擇、雜交和遺傳漂變因素均可以重塑群體的PAV特征。另外，PAV-GWAS和功能研究發(fā)現(xiàn)，IGF2BP1基因啟動子區(qū)存在著L1和L2兩種突變類型，與雞多個生長/體尺性狀顯著相關(guān)，并對相關(guān)數(shù)量性狀的表型方差貢獻(xiàn)很大。

該研究構(gòu)建的泛基因組，將為我國地方雞生長性狀形成的遺傳機(jī)制解析、資源鑒定和保護(hù)利用提供重要的理論指導(dǎo)；首次解析的位于27號染色體上影響雞生長性狀主效基因IGF2BP1的致因突變的分子標(biāo)記，將為我國“十四五”規(guī)劃中的種業(yè)振興，破解種業(yè)“卡脖子”問題，提供重要的技術(shù)支撐！

據(jù)悉，河南農(nóng)業(yè)大學(xué)建有河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點實驗室、河南省家禽育種國際聯(lián)合實驗室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等5個省部級研究平臺，擁有設(shè)施設(shè)備一流、保存了28個特色資源的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場?？迪酀淌趫F(tuán)隊是教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團(tuán)隊，一直致力于地方雞遺傳資源保護(hù)與利用研究。團(tuán)隊長期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護(hù)和利用開展研究，先后主持承擔(dān)國家“863”計劃、國家自然科學(xué)基金、河南省重大專項等國家和省部級科研項目50余項；育出特色新品系19個，新發(fā)現(xiàn)國家遺傳資源1個，培育國審新品種（配套系）3個，獲國家技術(shù)發(fā)明二等獎1項、國家科技進(jìn)步二等獎1項。

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團(tuán)隊介紹：

團(tuán)隊為教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團(tuán)隊，現(xiàn)有核心成員15名，均具有博士學(xué)位。其中，中原學(xué)者、省特聘教授各1人，河南省認(rèn)定的高層次人才6人，博士（碩士）生導(dǎo)師4人，碩士生導(dǎo)師10人。團(tuán)隊長期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護(hù)和利用開展研究，先后主持承擔(dān)國家“863”計劃、國家自然科學(xué)基金、河南省重大專項等國家和省部級科研項目50余項。育出特色新品系19個，新發(fā)現(xiàn)國家遺傳資源1個，培育國審新品種（配套系）3個；發(fā)表學(xué)術(shù)論文430余篇，其中SCI文章100余篇。出版著作27部；獲授權(quán)發(fā)明專利38項；培養(yǎng)博士、碩士研究生150余人；主持獲國家技術(shù)發(fā)明獎、國家科技進(jìn)步獎二等獎各1項。

依托團(tuán)隊建有河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點實驗室、河南省家禽育種國際聯(lián)合實驗室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等5個省部級研究平臺，以及設(shè)施設(shè)備一流、保存28個特色資源的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場。